Eigentlich empfielt es sich, Druckfraben in CMYK anzulegen und nicht in RGB, da RGB eben Lichtfarben und keine Druckfarben sind. Die Farbräume sind nicht immer 1:1 kompatibel und daher kommt es häufiger zu Farbveschiebungen. Ich nehme an, beim anspreichern ins PDF wurden die Farben in CMYK umgewandelt?!
Ich würde jedenfalls mein Dokument mal auf CMYK umstellen, den Grünwert optisch soweit anpassen, dass er mir gefällt und darauf achten, dass im Farbprofil "Euroscale Coated v2" bzw. "European Prepress Defaults" angegeben ist. Eigentlich sollte dann zumindest kein Unterschied mehr zwischen Illustrator und PDF zu sehen sein. Es kann aber schon noch eine Farbverschiebung beim eigentlichen Drucken entstehen. Um Bildschirm und Drucker abzugleichen, kann man den Bildschirm entsprechend kalibrieren.

Grüsse
Samy