Wenn ich das richtig sehe ist der Skalierungsfaktor geräteabhängig. Ich tippe auf den undruckbaren Randbereich. Drucke ich daheim eine exakt 210/297mm große PDF auf meinem Laserjet6L, wird sie mit rund 99% skaliert, hier an der Uni auf einem Lexmark Optra Laser mit rund 97%. Eigentlich besteht gar kein Skalierungsgrund, das sehe ich genauso. Wie groß das faktisch enthaltene graphische Material ist, interessiert den Acrobat Reader nicht, die Papiergröße des Dokuments ist fix. InDesign hingegen interessiert das beim Plazieren einer PDF sehr wohl, der Rahmen wird auf das enthaltene Datenmaterial beschnitten.