Du beantwortest die Frage eigentlich schon selber: die entscheidenden Tage sind die 2-3 Tage in der Uni kurz vor Abgabe. Da macht sich ein Desktop schlecht. -> Laptop mit C2D mit 2,4 - 2,6 Ghz und mind. 4GB Ram.
Dazu kaufst Du Dir für zuhause einen großen LCD-Monitor mit gutem Bild.
Und für das Laptop die Backup-Festplatte nicht vergessen. Am besten eine, auf die man via WLAN (n-Standard) zugreifen kann, und auf die Dein Backupprogramm bei Verfügbarkeit automatisch ein Backup macht.