Du kannst z.B. Word Dokumente direkt in InDesign einbinden. Für längere Wissenschaftliche Texte (viele Fussnoten, vernünftiger Index, Inhaltsverzeichnis) würde ich LaTex empfehlen. Die Dateneingabe ist am Anfang zwar etwas ungewohnt, dafür ist das Ergebnis umso sehenswerter und auch lange Dokumente lassen sich mühlos strukturieren und bearbeiten. Als komfortables Frontend kann ich da TeXnixCenter für Windows (http://www.toolscenter.org/products/...nter/index.htm) empfehlen. Auch für die meisten anderen Betriebssysteme gibt es ähnliche Programme.
Latex erstellt problemlos ps dateien, die Du in InbDesign einbinden kannst.

Gruss Flo